Analiza obliczeniowa stresu cieplnego u roślin

Globalne ocieplenie jest jednym z wyzwań, przed którymi stoimy w dzisiejszych czasach. Skutki globalnego ocieplenia nie ograniczają się wyłącznie do ludzi - odczuwają je również rośliny. Wzrost temperatury powoduje u roślin stres cieplny, co ostatecznie prowadzi do obniżenia jakości i ilości plonów. Obecnie istnieje pilna potrzeba opracowania odmian roślin uprawnych o zwiększonej tolerancji termicznej. W niniejszym raporcie wykorzystaliśmy techniki eksploracji danych, aby wykazać, że stres cieplny jest istotnym czynnikiem wpływającym na produkcję rolną. Na poziomie molekularnym wykazano, że u roślin poddanych stresowi cieplnemu dochodzi do zmian w modyfikacjach potranslacyjnych. Zbadaliśmy palmitoilację, sumoilację, S-nitrozylację i nitrowanie w sekwencjach genów roślinnych związanych ze stresem cieplnym oraz niezwiązanych z nim. Wykazaliśmy, że sumoilacja jest ważną właściwością, na którą prawdopodobnie ma wpływ duża liczba białek związanych ze stresem cieplnym u szerokiej gamy roślin. Właściwość tę można wykorzystać do identyfikacji nowych sekwencji związanych ze stresem cieplnym u roślin.

Globalne ocieplenie jest jednym z wyzwań, przed którymi stoimy w dzisiejszych czasach. Skutki globalnego ocieplenia nie ograniczają się wyłącznie do ludzi - odczuwają je również rośliny. Wzrost temperatury powoduje u roślin stres cieplny, co ostatecznie prowadzi do obniżenia jakości i ilości plonów. Obecnie istnieje pilna potrzeba opracowania odmian roślin uprawnych o zwiększonej tolerancji termicznej. W niniejszym raporcie wykorzystaliśmy techniki eksploracji danych, aby wykazać, że stres cieplny jest istotnym czynnikiem wpływającym na produkcję rolną. Na poziomie molekularnym wykazano, że u roślin poddanych stresowi cieplnemu dochodzi do zmian w modyfikacjach potranslacyjnych. Zbadaliśmy palmitoilację, sumoilację, S-nitrozylację i nitrowanie w sekwencjach genów roślinnych związanych ze stresem cieplnym oraz niezwiązanych z nim. Wykazaliśmy, że sumoilacja jest ważną właściwością, na którą prawdopodobnie ma wpływ duża liczba białek związanych ze stresem cieplnym u szerokiej gamy roślin. Właściwość tę można wykorzystać do identyfikacji nowych sekwencji związanych ze stresem cieplnym u roślin.